2009年1月5日-13日，应台湾政治大学东亚研究所邀请，国际问题研究所一行6人在所长阎学通教授的带领下赴台湾进行了学术交流和访问。其间，与台湾政治大学东亚研究所举办了“全球化下的东亚区域合作”联合学术研讨会，访问了台湾大学、政大国际关系研究中心、亚太和平基金会、中山大学和台湾大陆工作委员会，并与台湾政治大学达成了关于中国古代政治思想的合作研究项目。国际问题研究所教师此次访台受到台湾有关方面的关注和重视，台湾考试院院长关中先生宴请了国际问题研究所教师。《中国时报》、《联合报》等媒体对国际所教师的在台活动进行了报道。国际问题研究所教师代表团此次访台对推动两岸的学术交流起到了积极作用。